Conèixer la variant del contagi per a anticipar-se al seu desenvolupament clínic i combatre-la eficaçment, objectiu del nou test d’Ascires Sistemas Genómicos, laboratori d’Ascires, grup biomèdic del que forma part Cetir
- Les variants són diferents quant a major risc de gravetat de la malaltia, major capacitat de transmissió i major resistència a determinades vacunes, informació clau per a abordar cada cas.
- Segons acaba d’establir el Ministeri de Sanitat, tots els contactes estrets –fins i tot els vacunats amb pauta completa– d’una persona infectada per les variants brasilera, sud-africana i índia hauran de complir quarantena.
- Davant la sospita de reinfecció després d’un episodi previ de Covid o d’infecció postvacunació, és crucial identificar la variant del nou contagi per a comprendre i abordar el procés.
Barcelona, 8 de juliol de 2021.- Un nou test genètic permet identificar fins a quatre possibles variants del SARS-CoV-2 inicial originat a la Xina, les variants del coronavirus de major impacte en la salut pública: alfa, beta, gamma, delta i delta plus (conegudes també com a britànica, sud-africana, brasilera i índies, respectivament). Es tracta de la nova PCR Variant d’Ascires Sistemas Genómicos, laboratori del grup biomèdic del qual forma part la catalana Cetir. Mitjançant aquesta PCR es duu a terme un genotipatge de la mostra positiva per coronavirus per a identificar alguna d’aquestes cinc variants com a agents causants de la infecció.
Conèixer la variant del contagi és molt rellevant a nivell clínic i epidemiològic, així com de cara a l’entorn personal o familiar del pacient. Les cinc soques esmentades –principalment la delta i delta plus– es relacionen amb una major transmissibilitat, ja que totes inclouen una mutació en la proteïna de l’espícula (clau d’entrada en la cèl·lula humana) que augmenta la seva capacitat de propagació.
A més, la variant britànica (ja majoritària a Espanya), l’índia (dominant al Regne Unit, Rússia, Portugal i l’Índia, i en plena expansió a tot Europa) i la brasilera s’associen, cosa que incrementa la gravetat del virus respecte de la soca nativa, segons els indicis recollits en diferents estudis científics. Per la seva banda, la sud-africana i la delta plus es caracteritzen per una major capacitat per a escapar a l’acció dels anticossos generats després de la infecció natural o per determinades vacunes.
“Des de la perspectiva mèdica, conèixer la variant que provoca la infecció ens proporciona una informació molt valuosa, ja que ens permet personalitzar l’atenció clínica. Si es tracta d’una soca que s’associa a una major gravetat de la malaltia, podem intensificar el seguiment del pacient o establir un control més rigorós a través de proves complementàries d’imatge, per exemple”, exposa la doctora Amparo García, de l’equip mèdic d’Ascires.
“Al principi de la pandèmia ho desconeixíem gairebé tot sobre el virus. Ara, el seu estudi a nivell genòmic ens dona la possibilitat d’anticipar-nos i de combatre’l de manera més segura”, defensa la doctora García.
Si es tracta d’una variant més transmissible caldria extremar –encara més, si cal– totes les mesures de protecció de cara a l’entorn personal i familiar del pacient.
A més, així com una informació més precisa sobre les variants del virus resulta útil a nivell clínic per al pacient afectat, també modula les pautes oficials de salut pública.
Quarantena per a contactes estrets, fins i tot vacunats
Segons ha establert recentment el Ministeri de Sanitat, tots els contactes estrets –també aquells amb pauta completa de vacunació o que hagin passat la infecció covid en els 6 mesos previs– d’una persona infectada per les variants beta, gamma o delta, hauran de guardar quarantena. Aquest canvi de protocol, recollit en l’actualització de l’estratègia de detecció precoç, vigilància i control de Covid-19 del Ministeri, es relaciona amb “el major risc de fuita immunitària” de les variants sud-africana, brasilera i índia.
No obstant això, si es tracta d’un contagi per variant alfa (britànica), els contactes estrets vacunats amb pauta completa o que hagin passat la covid en els últims 6 mesos no estan obligats a confinar-se.
Clau davant la sospita de reinfecció
Així, la identificació de la variant que ha generat el contagi és també clau en els casos de “sospita de reinfecció o qualsevol altre fenomen de fuita a la resposta immune”, tal com estableix el Ministeri de Sanitat en el protocol d’Integració de la Seqüenciació Genòmica en la Vigilància del SARS-CoV-2.
“En els casos de pacients que han passat la covid fa més de 90 dies o que ja han estat vacunats i donen positiu en una PCR, seria molt important la identificació de la variant que ha provocat la nova infecció per a ajudar-nos a comprendre el procés i l’abordatge d’aquest”, argumenta la doctora García.
L’anàlisi de la variant es realitza sobre la mostra nasofaríngia o de saliva que ha donat positiu per coronavirus en qualsevol de les proves moleculars que ofereix Ascires: PCR Multiplex (convencional), PCR Fast (ràpida) i PCR Saliva. Sobre aquesta mostra positiva, es fa una segona PCR (PCR Variant) per a detectar les mutacions que han donat origen a les cinc variants del virus.
Aquest servei també està disponible en format kit perquè hospitals i centres de salut especialitzats desenvolupin l’anàlisi de genotipatge amb les seves pròpies mostres.
D’altra banda, a més de la PCR Variant, que detecta si la infecció procedeix d’alguna de les cinc variants esmentades, Ascires Sistemas Genómicos també té la capacitat de seqüenciar les mostres positives de SARS-Cov-2 per a identificar qualsevol altra soca del virus.
De fet, observar com evoluciona el virus en la població i conèixer quines són les variants predominants també és crucial per al control de la pandèmia. “A nivell epidemiològic aquesta informació és clau per a poder adaptar possibles pautes de seguiment o de protecció”, exposa la directora d’Ascires Sistemas Genómicos, Mayte Gil.
Sobre Ascires Sistemas Genómicos
Ascires Sistemas Genómicos forma part del grup biomèdic Ascires, líder a Espanya en Genètica, Diagnòstic per Imatge i Medicina Nuclear, a més de ser un referent en Oncologia Radioteràpica. D’arrels mediterrànies i amb una trajectòria de més de 50 anys, el grup Ascires (del qual també forma part la catalana Cetir) centra la seva activitat en diagnòstic i tractament, reinvertint anualment una mitjana del 20% dels beneficis en R+D+i. A més, el grup fa accessibles els avantatges del diagnòstic genètic a través de la seva xarxa de Clíniques Biomèdiques Ascires.
